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果胶酯酶通过调节果胶的甲酯化程度，影响果胶的物理化学性质，从而改变细胞壁的弹性和延展性。在植物生长和发育过程中，细胞壁需要不断地进行构建和重塑，果胶酯酶在此过程中发挥关键作用
果胶酯酶的活性测定通常是以果胶为底物，通过测定在一定条件下产生的羧基（常用NaOH滴定）或甲醇的量来确定其活性。
果胶酯酶的适pH值范围和温度条件可能因酶源而异，测定时需根据具体情况进行调整。测定过程中需严格控制反应时间和条件，以确保结果的准确性。
果胶是植物细胞壁的主要成分之一，是一种复杂的多糖，主要由半乳糖醛酸以α-1,4-糖苷键连接而成，并且部分半乳糖醛酸的羧基被甲酯化。果胶酯酶能够特异性地作用于这些甲酯化的半乳糖醛酸残基，通过水解作用去掉甲酯基团，从而生成果胶酸和甲醇。这个过程是逐步进行的，从果胶分子的非还原端开始，逐个脱去甲酯基团
在果汁加工中，果胶酯酶能够分解果肉中的果胶物质，使果肉细胞之间的连接变得松散，从而促进果汁的释放，提高出汁率。
果胶是导致果汁浑浊的主要原因之一，果胶酯酶可以将果胶分解为小分子物质，降低果汁的黏度，使果汁中的悬浮颗粒沉淀下来，从而达到澄清果汁的目的，提高果汁的透明度和稳定性
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