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作为生物缓冲剂，3-吗啉丙磺酸的有效pH缓冲范围为6.5-7.9，pKa值为7.2（25℃）。由于其pKa值接近生理pH7.4
3-吗啉丙磺酸特别适合用于生理相关的缓冲液，如哺乳动物细胞的培养（浓度应≤20 mM）、RNA变性琼脂糖凝胶电泳实验等
3-吗啉丙磺酸（MOPS）在RNA电泳缓冲液中的主要应用是提供稳定的pH环境，增强电泳效果，并保护RNA免受损伤。
在RNA电泳过程中，MOPS作为缓冲剂，能够有效地维持缓冲液的pH值在合适的范围内。RNA在不同的pH条件下可能会发生降解或结构变化，因此需要一个稳定的pH环境来RNA的完整性。MOPS的这一特性能够防止RNA的降解，从而电泳结果的准确性
MOPS可以提高RNA在电场中的迁移率，使RNA能够更快速、更清晰地分离。同时，它还可以减少RNA与凝胶之间的非特异性吸附，进一步提高电泳的分辨率
MOPS具有一定的抗氧化和抗水解能力，可以保护RNA免受外界因素的损伤，延长RNA的保存时间。这些特性使得MOPS成为RNA电泳缓冲液中的重要成分。
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